
El reloj de la e‑facturación corre: cada pequeña empresa necesitará pronto un programa de facturación para pyme certificado. Esta guía 2025 explica por qué y compara las plataformas líderes para que cambies con confianza.
Muchos propietarios siguen copiando y pegando facturas en Word. Ese hábito provoca sanciones, retrasos en los cobros y noches buscando números de IVA. Los mejores programas de facturación solucionan los tres problemas: crean facturas legales en segundos, persiguen deudores y sincronizan cada venta con tu contabilidad. Veamos cómo.
Preguntas rápidas y respuestas
¿Todas las pymes necesitan un programa de facturación? Sí. Dentro de los dos años posteriores a la orden ministerial definitiva, todas las empresas - hasta el último autónomo - deberán emitir e‑facturas Verifactu‑ready.
¿Qué hace que una herramienta esté “lista para Verifactu”? Genera un archivo XML Facturae 3.2.2 inmutable (opcional UBL), estampa un código QR, incrusta un hash CSV único y puede enviar el registro a la AEAT en tiempo real.
¿Son suficientes los planes gratuitos?A menudo sí para microempresas que envían menos de 25 facturas al mes, pero los planes de pago suelen ser necesarios cuando necesitas presentar los Modelos 303/390. Por encima de ese volumen necesitarás usuarios extra y declaraciones de IVA.
Programa de facturación para pymes: Por qué importa en 2025
Nueva ley de e‑facturación: las empresas con más de 8 millones de euros de facturación deberán cambiar un año después de la publicación de la orden ministerial; el resto tiene dos años. Los flujos en papel o PDF exponen a las pymes a multas y errores manuales. El programa de facturación y contabilidad para pymes automatiza IVA, IRPF y el estado de los pagos.
Mejores plataformas de facturación - Resumen de funciones y precios
- renn - Único con plan gratuito que cubre 25 facturas al mes y prepara impuestos con IA. Verifactu‑ready desde el primer día. Pruébalo aquí.
- Holded - ERP en la nube con facturación, CRM e inventario. Planes desde 25 € / mes. Trabaja para obtener la homologación de la AEAT.
- Cuéntica - Contabilidad y facturación primero por 15 € / mes. Pensado para los Modelos 303 y 130.
- Quipu - Desde 14 € / mes e incluye acceso a asesores fiscales certificados.
- Sage 50cloud - Suite híbrida escritorio‑nube con sólido módulo de inventario y herramientas de IVA.
- Zoho Invoice - Aplicación global, gratuita hasta cinco facturas al mes: una prueba suave para microempresas.
- STEL Order - Con sede en Murcia, ofrece un módulo de e‑factura gratuito para el cumplimiento rápido de Crea y Crece.
- QuickBooks Online - Sincronización en tiempo real entre facturas, pagos y libros contables; precios por suscripción mensual.
Programa de facturación y contabilidad para pymes - Opciones todo en uno
Las suites integradas como renn, Holded, Sage 50cloud y QuickBooks evitan la doble entrada: cada venta se contabiliza al instante en el libro mayor y en los reportes de IVA. El acceso en la nube permite que asesores externos entren sin transferir archivos. Según el Wolters Kluwer Advisory Barometer 2025, el 71 % de las firmas de asesoría españolas ya han adoptado nuevo software contable y de facturación para pequeñas empresas para adelantarse a las normas de e‑facturación.
Busca funciones como conciliación bancaria, nóminas adicionales y soporte multi‑entidad si vendes en el extranjero. Las automatizaciones con IA -captura OCR de gastos y alertas de anomalías - ya vienen de serie en la mayoría de los planes medios; inclúyelas al calcular el ROI.
Plataformas de facturación para pymes - líderes del mercado
Holded
Facturación aprobada por la AEAT más CRM, inventario y RR. HH. en un solo panel. Se integra con Shopify, Stripe y Zapier para operaciones de extremo a extremo.
Quipu
Facturación compatible con Verifactu, recibos digitales y seguimiento del IRPF. Accede a un mercado de asesores fiscales humanos cuando lo necesites.
Cuéntica
Interfaz sencilla con paneles de flujo de caja completos: ideal para pymes de servicios.
STEL Order
Su versión gratuita ya cumple la ley de e‑facturación. Diseñado para oficios y servicios de campo que dependen de aplicaciones móviles.
Contasol
Herramienta de escritorio veterana. El núcleo es gratuito; 24 € / mes desbloquean actualizaciones en la nube e integraciones con Microsoft Office.
Software de contabilidad y facturación para pequeñas empresas - Coste y ROI
Las herramientas cloud básicas oscilan entre 10 € y 30 € al mes. Hay planes gratuitos pero suelen limitar facturas o eliminar declaraciones de IVA. Una pyme típica ahorra de seis a ocho horas administrativas al mes cuando la facturación y los feeds bancarios automatizan la conciliación. Evita costes ocultos: usuarios adicionales, informes avanzados y add‑ons de asesoría pueden duplicar el precio inicial - revisa los límites del plan.
Usar un programa de facturación no conforme puede costar hasta 50 000 € por año de uso (y 150 000 € para desarrolladores/distribuidores), así que las herramientas de validación de campos se amortizan rápidamente.
Programa de facturación listo para Verifactu - Checklist de cumplimiento
- Genera un archivo XML Facturae 3.2.2 inmutable (opcional UBL).
- Incrusta un código QR en cada factura.
- Envía una copia a la AEAT al instante.
- Dispone de carta de homologación de la AEAT.
- Crea un CSV único para cada factura.
Opciones ya certificadas: renn, Holded, Quipu, Cuéntica, STEL Order, además del próximo portal gratuito de la AEAT.
Planifica la migración con antelación: los proveedores necesitan semanas para mapear los datos antiguos a las nuevas estructuras y formar al personal.
Para el texto legal completo, consulta el sitio de la Agencia Tributaria.
Integraciones y automatización - Conecta tu stack
Conexiones prioritarias: feeds bancarios (API BBVA, CaixaBank), pasarelas de pago (Stripe, PayPal), CRM y comercio electrónico.
Ideas de automatización: enviar recordatorios de impago por WhatsApp, guardar facturas pagadas en Google Drive y alimentar datos de flujo de caja en tu herramienta BI. Verifica si hay conectores REST abiertos o Zapier/N8N: los ecosistemas cerrados generan trabajo manual más adelante.
¿Necesitas una visión más amplia de las herramientas contables? Consulta nuestra guía de programa contabilidad online para autónomos y pequeñas empresas.
Conclusión
Empieza con una lista corta basada en cumplimiento, precio e integraciones. Ejecuta un piloto de 30 días antes de la migración completa. Invertir ahora evita las prisas de 2026 y prepara tu negocio para cobrar más rápido y llevar libros más limpios.